More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4130 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  71.43 
 
 
565 aa  816    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  100 
 
 
561 aa  1140    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
539 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  44.06 
 
 
572 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  45.97 
 
 
611 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  45.33 
 
 
611 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  44.48 
 
 
611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.92 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.14 
 
 
613 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.76 
 
 
566 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.29 
 
 
617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.58 
 
 
619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.89 
 
 
615 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.55 
 
 
564 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.72 
 
 
611 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 
633 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.42 
 
 
593 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.34 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.93 
 
 
571 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.79 
 
 
626 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.68 
 
 
612 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.17 
 
 
571 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  41.75 
 
 
571 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  44.84 
 
 
593 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.81 
 
 
562 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  42.91 
 
 
597 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.17 
 
 
592 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
601 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
633 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 
627 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  44.44 
 
 
613 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.29 
 
 
596 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.98 
 
 
712 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  43.01 
 
 
629 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.13 
 
 
549 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  43.99 
 
 
592 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  41.96 
 
 
552 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.66 
 
 
578 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.08 
 
 
640 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  42.42 
 
 
554 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  43.74 
 
 
575 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 
625 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
609 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
625 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  44.01 
 
 
599 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  43.21 
 
 
593 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  41.57 
 
 
575 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
637 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.34 
 
 
588 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  39.93 
 
 
629 aa  429  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.52 
 
 
583 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.53 
 
 
632 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.81 
 
 
619 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.42 
 
 
555 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 
571 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.61 
 
 
612 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 
623 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.09 
 
 
615 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
629 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 
623 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
539 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 
629 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  41.13 
 
 
555 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
623 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39.81 
 
 
617 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.19 
 
 
549 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
547 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  42.61 
 
 
612 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
623 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.77 
 
 
677 aa  425  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.8 
 
 
545 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.11 
 
 
609 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  41.32 
 
 
537 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 
623 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  43.27 
 
 
533 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
623 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  42.56 
 
 
570 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  41.34 
 
 
555 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  41.41 
 
 
556 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
711 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  42.3 
 
 
543 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 
676 aa  424  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  44.17 
 
 
540 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.01 
 
 
643 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
620 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  42.34 
 
 
579 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  42.93 
 
 
538 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  41.54 
 
 
630 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.49 
 
 
568 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  40.75 
 
 
539 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  41.92 
 
 
610 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  42.07 
 
 
609 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  42 
 
 
552 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
623 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.56 
 
 
617 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 
543 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.9 
 
 
633 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  41.64 
 
 
557 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>