More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00492 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  96.32 
 
 
571 aa  1140    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  59.58 
 
 
572 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  91.94 
 
 
571 aa  1086    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  100 
 
 
571 aa  1173    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  85.49 
 
 
566 aa  1019    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.66 
 
 
564 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.32 
 
 
575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.54 
 
 
546 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
609 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
539 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.55 
 
 
615 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.16 
 
 
612 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.64 
 
 
578 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  46.11 
 
 
586 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  45.07 
 
 
611 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  41.48 
 
 
627 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  45.89 
 
 
611 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
633 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.66 
 
 
617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 
629 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
627 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.83 
 
 
712 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  45 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  45.3 
 
 
633 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.99 
 
 
632 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
676 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 
625 aa  465  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  44.46 
 
 
611 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 
629 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  41.27 
 
 
623 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.92 
 
 
623 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 
625 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.59 
 
 
611 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.12 
 
 
568 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.27 
 
 
545 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.98 
 
 
617 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 
539 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
649 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 
544 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 
623 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 
629 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.41 
 
 
583 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  40.03 
 
 
617 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 
633 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.5 
 
 
613 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.88 
 
 
632 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 
634 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.12 
 
 
634 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  43.53 
 
 
542 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.53 
 
 
543 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 
674 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 
634 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.48 
 
 
609 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
593 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.64 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  44.56 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.87 
 
 
610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.67 
 
 
611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  41.09 
 
 
640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.16 
 
 
568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.54 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 
623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  44.99 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  44.64 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 
623 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.62 
 
 
630 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  44.23 
 
 
640 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
708 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.93 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.55 
 
 
626 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 
623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 
631 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.55 
 
 
658 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.93 
 
 
593 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.7 
 
 
592 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  42.68 
 
 
536 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  43.35 
 
 
538 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
623 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
623 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.17 
 
 
620 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.8 
 
 
640 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  42.66 
 
 
619 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.52 
 
 
592 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
620 aa  452  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  44.21 
 
 
567 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  43.13 
 
 
606 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.4 
 
 
530 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  44.27 
 
 
544 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
601 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  41.19 
 
 
552 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.67 
 
 
566 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  44.11 
 
 
571 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.13 
 
 
619 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  42.81 
 
 
664 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>