More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5661 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 
553 aa  1120    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  70.85 
 
 
557 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.86 
 
 
552 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  80.29 
 
 
551 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  80.11 
 
 
551 aa  882    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  79.56 
 
 
551 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  69.05 
 
 
553 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.81 
 
 
611 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
613 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.18 
 
 
614 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  58.92 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.06 
 
 
613 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  55.23 
 
 
613 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  56.64 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  56.88 
 
 
624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  56.68 
 
 
665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  56.88 
 
 
624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  56.72 
 
 
624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  56.88 
 
 
624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  56.9 
 
 
621 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  55.9 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  54.68 
 
 
603 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  55.43 
 
 
550 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.96 
 
 
582 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.69 
 
 
540 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  48.23 
 
 
551 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.13 
 
 
540 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.13 
 
 
540 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  47.97 
 
 
543 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  47.6 
 
 
543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.07 
 
 
543 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  46.41 
 
 
545 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  47.66 
 
 
551 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  45.9 
 
 
535 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  45.9 
 
 
538 aa  452  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  45.66 
 
 
530 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  46.78 
 
 
531 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.29 
 
 
563 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.67 
 
 
532 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  39.65 
 
 
566 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
607 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.7 
 
 
565 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  39.56 
 
 
603 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  38.24 
 
 
569 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.48 
 
 
571 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  40.46 
 
 
547 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.47 
 
 
571 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  39.36 
 
 
606 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 
547 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  39.2 
 
 
534 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.34 
 
 
568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.89 
 
 
616 aa  363  5.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
536 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  38.46 
 
 
570 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.09 
 
 
619 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.3 
 
 
576 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  39.78 
 
 
541 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  37.12 
 
 
571 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.07 
 
 
539 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.3 
 
 
541 aa  360  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.01 
 
 
612 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
536 aa  359  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.7 
 
 
538 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.07 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.08 
 
 
578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  37.04 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  40.86 
 
 
539 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  38.84 
 
 
609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.26 
 
 
555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  40.19 
 
 
533 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.19 
 
 
550 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  36.92 
 
 
583 aa  356  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
571 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.5 
 
 
575 aa  356  6.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
602 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  41.74 
 
 
557 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  38.78 
 
 
557 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.64 
 
 
546 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  38 
 
 
561 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.41 
 
 
565 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  42.83 
 
 
545 aa  354  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  40.54 
 
 
540 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  38.4 
 
 
557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  38.3 
 
 
640 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  36.79 
 
 
619 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  38.52 
 
 
599 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  37.13 
 
 
553 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 
539 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  36.96 
 
 
561 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.86 
 
 
540 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  37.59 
 
 
623 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  39.63 
 
 
550 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  40.04 
 
 
564 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  40.39 
 
 
540 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  37.66 
 
 
615 aa  350  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  39.49 
 
 
547 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  37.62 
 
 
545 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
539 aa  349  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.58 
 
 
563 aa  349  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>