More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0154 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  95.6 
 
 		 613 aa  1188    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  100 
 
 		 613 aa  1234    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  60.57 
 
 		 613 aa  738    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.45 
 
 		 582 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  61.06 
 
 		 608 aa  732    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  61.03 
 
 		 611 aa  718    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  60.47 
 
 		 614 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  60.97 
 
 		 665 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  57.84 
 
 		 624 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  57.96 
 
 		 624 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  64.06 
 
 		 550 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  58.54 
 
 		 624 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  57.84 
 
 		 624 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  58.46 
 
 		 621 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  64.8 
 
 		 546 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  61.46 
 
 		 614 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.06 
 
 		 553 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  56.8 
 
 		 551 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  57.14 
 
 		 551 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  52.6 
 
 		 603 aa  598  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  57.54 
 
 		 551 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  55.99 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  54.83 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  49.35 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  49.72 
 
 		 551 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.88 
 
 		 540 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  49.35 
 
 		 540 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  49.54 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  49.72 
 
 		 540 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  47.87 
 
 		 545 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  48.62 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  48.25 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  49.07 
 
 		 538 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  47.65 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.07 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  46.94 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.88 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.58 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  40.46 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  38.36 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  39.53 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.94 
 
 		 534 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 524 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.19 
 
 		 534 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.7 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 594 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  41.81 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.77 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.2 
 
 		 550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 607 aa  353  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.91 
 
 		 584 aa  353  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.62 
 
 		 566 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  39.25 
 
 		 538 aa  350  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.37 
 
 		 583 aa  350  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 867 aa  350  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  38.28 
 
 		 560 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  38.09 
 
 		 563 aa  349  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.07 
 
 		 543 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  39.07 
 
 		 543 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.07 
 
 		 543 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  38.63 
 
 		 554 aa  349  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 565 aa  348  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  36.79 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  38.49 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  37.64 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.63 
 
 		 565 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  39.35 
 
 		 532 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.58 
 
 		 538 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  36.07 
 
 		 606 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  38.32 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.27 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  38.53 
 
 		 541 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 535 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  37.94 
 
 		 555 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.41 
 
 		 596 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  35.77 
 
 		 568 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  36.98 
 
 		 593 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  40 
 
 		 534 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  36.3 
 
 		 609 aa  343  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 541 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  37.65 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  34.84 
 
 		 572 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.81 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  38.32 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  39.73 
 
 		 527 aa  341  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  35.17 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  35.66 
 
 		 561 aa  340  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.99 
 
 		 619 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  36.21 
 
 		 588 aa  339  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  35.1 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  36.43 
 
 		 566 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  38.07 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.3 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  37.22 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  36.43 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>