More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2116 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 553 aa  1113    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  52.14 
 
 		 613 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  52.41 
 
 		 608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  53.09 
 
 		 605 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  48.46 
 
 		 577 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  43.47 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 593 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.37 
 
 		 583 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.89 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.73 
 
 		 543 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  44.02 
 
 		 633 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.56 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  45.09 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  44.23 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  41.99 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.7 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  45.66 
 
 		 550 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  43.4 
 
 		 573 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  46.28 
 
 		 542 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.95 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.68 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.73 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 		 632 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  40.18 
 
 		 564 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.72 
 
 		 609 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.44 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.96 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 		 623 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.48 
 
 		 629 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.13 
 
 		 612 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  43.64 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2318  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 529 aa  422  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.86 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.82 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.76 
 
 		 623 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.29 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  46.18 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  44.54 
 
 		 630 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.13 
 
 		 612 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.86 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 633 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  43.64 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.88 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  46 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.46 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  46.2 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 529 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  43.85 
 
 		 568 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  43.43 
 
 		 619 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40.07 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.39 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 		 625 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.28 
 
 		 632 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  43.47 
 
 		 533 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 623 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  43.82 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  43.4 
 
 		 583 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  41.64 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  43.82 
 
 		 529 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  43.66 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 529 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  39.42 
 
 		 530 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 		 649 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  40.74 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.51 
 
 		 612 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 634 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.98 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.97 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.16 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.29 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  41.67 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  44.54 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  43.01 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  43.01 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  39.42 
 
 		 530 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  42 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  44.54 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.15 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  44.54 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 		 623 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  40.89 
 
 		 606 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39.25 
 
 		 617 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>