More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6441 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  99.36 
 
 		 624 aa  1244    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.99 
 
 		 613 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.84 
 
 		 613 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.34 
 
 		 582 aa  651    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  60.99 
 
 		 608 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  61.7 
 
 		 614 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  77.6 
 
 		 665 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.54 
 
 		 611 aa  731    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  61.14 
 
 		 614 aa  725    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  100 
 
 		 624 aa  1250    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  91.84 
 
 		 624 aa  1121    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  99.84 
 
 		 624 aa  1249    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  93.59 
 
 		 621 aa  1143    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  55.57 
 
 		 603 aa  663    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  63.09 
 
 		 613 aa  751    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  58.33 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  60.97 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  57.99 
 
 		 551 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  59.7 
 
 		 550 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.7 
 
 		 552 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.88 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  59.11 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  60.04 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  59 
 
 		 551 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  49.82 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  49.82 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  50.96 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  47.99 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.71 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  49.45 
 
 		 543 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.35 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  48.42 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.54 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  48.71 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.17 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  49.05 
 
 		 538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  44.84 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  41.16 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.2 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.74 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 623 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.76 
 
 		 536 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  38.32 
 
 		 593 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  38.75 
 
 		 623 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  40.19 
 
 		 538 aa  360  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  39.52 
 
 		 603 aa  359  9e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  39.56 
 
 		 549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  42.1 
 
 		 518 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 524 aa  356  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 607 aa  356  8.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 		 669 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  38.59 
 
 		 546 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.46 
 
 		 613 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  40.04 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  39.6 
 
 		 539 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.29 
 
 		 597 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  40 
 
 		 546 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  39.63 
 
 		 541 aa  352  8e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  39.78 
 
 		 539 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  37.4 
 
 		 561 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  37.73 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.74 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.2 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 541 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  39.74 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.74 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.56 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.55 
 
 		 575 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  39.42 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.51 
 
 		 571 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 544 aa  350  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  37.64 
 
 		 549 aa  350  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 540 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  38.55 
 
 		 619 aa  349  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.33 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  38.03 
 
 		 576 aa  348  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5689  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34468  normal  0.261455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  38.31 
 
 		 539 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  36.41 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.92 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  39.81 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.37 
 
 		 640 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  37.46 
 
 		 606 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  34.64 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  40.56 
 
 		 527 aa  347  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  38.36 
 
 		 534 aa  347  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  38.73 
 
 		 532 aa  347  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  36.64 
 
 		 619 aa  347  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.53 
 
 		 540 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.52 
 
 		 570 aa  347  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  37.76 
 
 		 640 aa  346  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  40.15 
 
 		 547 aa  347  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  37.81 
 
 		 615 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 623 aa  346  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>