More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1925 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  73.24 
 
 		 551 aa  819    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 552 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  73.96 
 
 		 551 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  67.4 
 
 		 557 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  74.32 
 
 		 551 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  66.55 
 
 		 553 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.86 
 
 		 553 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  54.46 
 
 		 613 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  57.49 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  57.7 
 
 		 624 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  57.7 
 
 		 624 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  57.7 
 
 		 624 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  57.62 
 
 		 624 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  57.65 
 
 		 621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 		 614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.47 
 
 		 611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 613 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  56.67 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  54.55 
 
 		 613 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 		 614 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  55.45 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  55.32 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  53.56 
 
 		 603 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  53.78 
 
 		 582 aa  535  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  49.17 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  49.54 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  49.17 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.53 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.89 
 
 		 540 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.89 
 
 		 540 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.61 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  47.4 
 
 		 551 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  46.58 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  46.49 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  46.74 
 
 		 538 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  45.97 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.62 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.25 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  40.37 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  40.18 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.53 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.33 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  45.17 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  40.15 
 
 		 603 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  39.23 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  38.91 
 
 		 570 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  41.11 
 
 		 556 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.73 
 
 		 550 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.12 
 
 		 616 aa  362  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  40.46 
 
 		 573 aa  362  9e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 565 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.46 
 
 		 568 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  41.28 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  37.74 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 607 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  40.98 
 
 		 538 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  40.96 
 
 		 565 aa  359  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 539 aa  359  9e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  39.78 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  40.3 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  40.04 
 
 		 561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  38.51 
 
 		 619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  41.49 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  42.83 
 
 		 548 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.26 
 
 		 546 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 602 aa  356  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  40.07 
 
 		 539 aa  356  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  40.11 
 
 		 557 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.52 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  42.43 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  37.96 
 
 		 576 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 		 524 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 548 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  41.41 
 
 		 546 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.48 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  38.1 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.89 
 
 		 615 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  41.59 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  39.85 
 
 		 557 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 571 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  40.82 
 
 		 539 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  36.78 
 
 		 561 aa  350  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.11 
 
 		 539 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.5 
 
 		 531 aa  349  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  37.94 
 
 		 545 aa  349  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  37.92 
 
 		 612 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  37.68 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  38.83 
 
 		 562 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.15 
 
 		 539 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  39.96 
 
 		 532 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  39.63 
 
 		 552 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  39.46 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  39.89 
 
 		 624 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.76 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  39.71 
 
 		 609 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  37.48 
 
 		 565 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>