More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2942 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 613 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.62 
 
 		 613 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  100 
 
 		 582 aa  1154    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  58.15 
 
 		 608 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  56.78 
 
 		 613 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  57.67 
 
 		 614 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  59.24 
 
 		 624 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  59.41 
 
 		 624 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  59.24 
 
 		 624 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.67 
 
 		 611 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  59.2 
 
 		 624 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  59.47 
 
 		 621 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  57.89 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  59.89 
 
 		 550 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  61.02 
 
 		 546 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  53.48 
 
 		 603 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  52.7 
 
 		 551 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  53.07 
 
 		 551 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  55.37 
 
 		 553 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.57 
 
 		 553 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 		 552 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  53.07 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  53.79 
 
 		 557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  50.47 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  50.4 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  50.09 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  49.22 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  48.78 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  50.48 
 
 		 551 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  48.68 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.52 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.05 
 
 		 530 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.86 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.29 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  47.65 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  45.68 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.99 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 		 602 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  41.7 
 
 		 543 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  41.7 
 
 		 543 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  40.23 
 
 		 535 aa  353  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  41.7 
 
 		 543 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.33 
 
 		 576 aa  350  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  37.64 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  40.08 
 
 		 565 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  42.56 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.46 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  39.47 
 
 		 550 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  41.95 
 
 		 550 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.93 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.27 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  38.64 
 
 		 553 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 607 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  40.68 
 
 		 527 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.94 
 
 		 534 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.32 
 
 		 538 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  39.41 
 
 		 583 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 546 aa  337  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  36.95 
 
 		 547 aa  336  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.89 
 
 		 575 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.34 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  37.81 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  41.34 
 
 		 538 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  35.45 
 
 		 619 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  38.69 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  40.96 
 
 		 592 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  40.86 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.58 
 
 		 592 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  37.1 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  40.38 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  35.61 
 
 		 522 aa  334  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 563 aa  334  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 539 aa  333  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  38.16 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.62 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  41.11 
 
 		 545 aa  333  7.000000000000001e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 548 aa  333  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  39.73 
 
 		 556 aa  333  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  38.88 
 
 		 867 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  38.36 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  39.89 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  37.28 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 543 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  39.88 
 
 		 558 aa  331  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  39.77 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 619 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  39.28 
 
 		 573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  34.23 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  35.71 
 
 		 586 aa  329  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 565 aa  329  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.12 
 
 		 540 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  36.46 
 
 		 571 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 		 623 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  40.57 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.2 
 
 		 546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>