More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1823 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  67.47 
 
 		 543 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  100 
 
 		 545 aa  1112    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  67.1 
 
 		 543 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  65.99 
 
 		 543 aa  708    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  54.33 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  51.3 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  51.11 
 
 		 540 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  52.8 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  51.11 
 
 		 540 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  51.49 
 
 		 530 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  52.13 
 
 		 538 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  53.09 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  52.04 
 
 		 531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  49.04 
 
 		 613 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 613 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  49.33 
 
 		 608 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.87 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  48.26 
 
 		 624 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  47.99 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  48.26 
 
 		 621 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  46.88 
 
 		 665 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  47.99 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  47.99 
 
 		 624 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  48.16 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  45.97 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 611 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 		 614 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.41 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.78 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 		 614 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  46.22 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  45.36 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  46.4 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  46.2 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  46.62 
 
 		 551 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  40.15 
 
 		 867 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  38.1 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  37.59 
 
 		 588 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  38.71 
 
 		 593 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 601 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  38.24 
 
 		 565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 593 aa  356  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  38.21 
 
 		 582 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  36.41 
 
 		 599 aa  352  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.5 
 
 		 596 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  35.82 
 
 		 583 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  39.1 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 571 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  38.81 
 
 		 575 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.32 
 
 		 619 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  39.88 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  37.76 
 
 		 563 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  37.04 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  37.41 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  37.08 
 
 		 612 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  36.36 
 
 		 571 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  36.78 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  39.63 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 571 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  36.83 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.1 
 
 		 578 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.19 
 
 		 570 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  37.06 
 
 		 615 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.12 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.15 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  37.63 
 
 		 613 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  36.43 
 
 		 542 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 629 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 623 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 		 623 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 623 aa  340  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 623 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.38 
 
 		 586 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  35.25 
 
 		 619 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  38.95 
 
 		 541 aa  339  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.45 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  36.09 
 
 		 606 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  36.16 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.57 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  37.57 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  39.37 
 
 		 540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.36 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  36.6 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  36.6 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  36.6 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.79 
 
 		 617 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  38.88 
 
 		 534 aa  336  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  36.62 
 
 		 552 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>