More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5003 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.96 
 
 
552 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  100 
 
 
551 aa  1116    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  70.77 
 
 
557 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  88 
 
 
551 aa  947    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  94.19 
 
 
551 aa  1057    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  69.75 
 
 
553 aa  760    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  80.29 
 
 
553 aa  900    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 
611 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 
613 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.29 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  59.51 
 
 
624 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  57.54 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  59.51 
 
 
621 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.14 
 
 
613 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  58.33 
 
 
624 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  58.33 
 
 
624 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  57.62 
 
 
608 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  58.33 
 
 
624 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  56.86 
 
 
665 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  54.01 
 
 
613 aa  588  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 
546 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  54.86 
 
 
603 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  56.78 
 
 
550 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.7 
 
 
582 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  49.16 
 
 
540 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  48.59 
 
 
540 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  46.93 
 
 
551 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  47.13 
 
 
543 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  47.5 
 
 
543 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  48.41 
 
 
540 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.71 
 
 
543 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  46.4 
 
 
545 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  45.81 
 
 
551 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  45.61 
 
 
535 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  45.51 
 
 
538 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  46.18 
 
 
530 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  46.13 
 
 
531 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.41 
 
 
532 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
563 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
607 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  40 
 
 
603 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.31 
 
 
566 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.59 
 
 
576 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.15 
 
 
616 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.42 
 
 
571 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  38.69 
 
 
565 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.8 
 
 
555 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  39.64 
 
 
606 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.75 
 
 
575 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  37.33 
 
 
619 aa  362  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.6 
 
 
539 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  38.09 
 
 
565 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  41.38 
 
 
540 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
541 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.6 
 
 
539 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.7 
 
 
538 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  41.01 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  38.09 
 
 
561 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  39.96 
 
 
555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  38.62 
 
 
579 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  39.77 
 
 
539 aa  356  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  41.97 
 
 
555 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  39.11 
 
 
570 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  40.33 
 
 
606 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  38.81 
 
 
586 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  38.39 
 
 
553 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.27 
 
 
558 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  38.85 
 
 
557 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.8 
 
 
547 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
559 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
539 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.54 
 
 
531 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  38.16 
 
 
546 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 
539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  41.09 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  40.6 
 
 
548 aa  353  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  40.22 
 
 
573 aa  353  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
554 aa  353  5e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  38.66 
 
 
557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  41.2 
 
 
545 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  40.96 
 
 
565 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
540 aa  352  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  39.01 
 
 
568 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  39.57 
 
 
555 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
541 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.18 
 
 
568 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
619 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  39.04 
 
 
609 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  39.63 
 
 
563 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
536 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  38.19 
 
 
569 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  35.96 
 
 
522 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  38.45 
 
 
546 aa  350  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  40.48 
 
 
547 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  39.15 
 
 
547 aa  350  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 
602 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.91 
 
 
619 aa  349  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 
609 aa  349  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.03 
 
 
543 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.03 
 
 
543 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>