More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2190 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  65.18 
 
 		 613 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  64.8 
 
 		 613 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  63.62 
 
 		 611 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  79.78 
 
 		 550 aa  847    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  62 
 
 		 613 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  70.87 
 
 		 608 aa  743    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  62.62 
 
 		 614 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.62 
 
 		 614 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 546 aa  1084    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  62.43 
 
 		 624 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  62.24 
 
 		 621 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  61.03 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  59.65 
 
 		 603 aa  615  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  61.02 
 
 		 582 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  61 
 
 		 624 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  61.18 
 
 		 624 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  61 
 
 		 624 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  57.56 
 
 		 551 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  57.01 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  58.88 
 
 		 557 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.9 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  57.01 
 
 		 553 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  57.43 
 
 		 551 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.03 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  51.75 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  51.57 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  51.66 
 
 		 540 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  48.96 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  49.35 
 
 		 543 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  47.65 
 
 		 551 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  50.56 
 
 		 551 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  48.6 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  48.73 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  47.95 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  48.68 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  49.53 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  46.83 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  39.66 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  41.85 
 
 		 560 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 554 aa  359  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.66 
 
 		 566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.88 
 
 		 549 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.56 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 539 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 867 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.58 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  39.46 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  39.58 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.58 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.37 
 
 		 531 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  42.38 
 
 		 538 aa  349  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.55 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.75 
 
 		 555 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  40.04 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.99 
 
 		 534 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  38.52 
 
 		 557 aa  346  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  39.29 
 
 		 539 aa  346  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  40.49 
 
 		 565 aa  346  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.87 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  40.68 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 546 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  42.19 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  38.48 
 
 		 619 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 535 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  36.93 
 
 		 522 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.32 
 
 		 546 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  36.85 
 
 		 588 aa  342  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 547 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  38.05 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  38.72 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  39.69 
 
 		 603 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  40.7 
 
 		 540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  37.67 
 
 		 556 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  35.83 
 
 		 583 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  38.67 
 
 		 576 aa  339  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  40 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.18 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  38.24 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.4 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.35 
 
 		 550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  40.26 
 
 		 566 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 563 aa  336  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  38.35 
 
 		 606 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  38.36 
 
 		 561 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.12 
 
 		 545 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  39.02 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  37.28 
 
 		 555 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  37.21 
 
 		 546 aa  334  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  38.76 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  37.29 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  39.46 
 
 		 557 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  38.36 
 
 		 558 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.5 
 
 		 597 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  36.96 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.55 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  38.13 
 
 		 550 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>