More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5559 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  57.93 
 
 		 573 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  100 
 
 		 570 aa  1149    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  72.41 
 
 		 575 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  57.58 
 
 		 583 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  55.76 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  48.52 
 
 		 624 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 		 629 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.65 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  47.11 
 
 		 630 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  48.2 
 
 		 612 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.26 
 
 		 612 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 623 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 623 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  48.26 
 
 		 612 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 		 623 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 		 629 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  47.02 
 
 		 625 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 		 627 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 623 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 623 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 623 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.2 
 
 		 613 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 		 623 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.32 
 
 		 617 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.73 
 
 		 568 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0598  ABC transporter related  49.3 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  48.43 
 
 		 624 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.41 
 
 		 640 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  48.18 
 
 		 611 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.02 
 
 		 629 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.86 
 
 		 615 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 629 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 623 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.24 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  47.4 
 
 		 597 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  47.7 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  47.74 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.42 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.53 
 
 		 632 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 623 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.66 
 
 		 619 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 		 632 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.3 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 625 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.79 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  46.69 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  47.67 
 
 		 613 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.97 
 
 		 625 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  42.2 
 
 		 627 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  46.42 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  47.31 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  45.74 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  43.98 
 
 		 617 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  47.64 
 
 		 611 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 		 633 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 601 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  45.88 
 
 		 619 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.16 
 
 		 586 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  44.71 
 
 		 583 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  48.65 
 
 		 547 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.13 
 
 		 547 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.23 
 
 		 606 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 		 637 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.69 
 
 		 593 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  45.52 
 
 		 582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  47.64 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.58 
 
 		 628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.33 
 
 		 643 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.43 
 
 		 649 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.05 
 
 		 619 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.54 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.1 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  46.14 
 
 		 538 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  45.45 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.3 
 
 		 634 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 		 634 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.22 
 
 		 599 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.66 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.18 
 
 		 562 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.11 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  47.47 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  40.9 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.06 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 676 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.72 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.22 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  45.3 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.36 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  45.6 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>