More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
597 aa  1163    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  51.28 
 
 
586 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  51.72 
 
 
603 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  55.08 
 
 
566 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
554 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
607 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  50.68 
 
 
619 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  48.31 
 
 
571 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
563 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  47.16 
 
 
564 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.64 
 
 
575 aa  495  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  47.8 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.85 
 
 
565 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  45.24 
 
 
569 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.2 
 
 
616 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
623 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.75 
 
 
640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
632 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.03 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.42 
 
 
633 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.14 
 
 
623 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
633 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  45 
 
 
562 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
623 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.8 
 
 
640 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  45.56 
 
 
615 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  46.06 
 
 
593 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.36 
 
 
649 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.7 
 
 
626 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 
629 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00740  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.14 
 
 
578 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  44.78 
 
 
624 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  46.01 
 
 
664 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  42.93 
 
 
619 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 
625 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
627 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 
623 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  45.02 
 
 
629 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.2 
 
 
547 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.17 
 
 
662 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.18 
 
 
571 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.44 
 
 
606 aa  452  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.18 
 
 
634 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  44.54 
 
 
609 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 
634 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
634 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  46.52 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 
662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.49 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 
629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.9 
 
 
630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  47.1 
 
 
592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  46.52 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 
673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  46.52 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 
673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  42.2 
 
 
588 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0325  putative ATP-binding ABC transporter protein  44.14 
 
 
685 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
633 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  46.75 
 
 
592 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 
623 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.72 
 
 
629 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
637 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.93 
 
 
599 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
609 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  46.75 
 
 
592 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  39.15 
 
 
647 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.39 
 
 
612 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.51 
 
 
611 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.39 
 
 
612 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.03 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 
623 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1769  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.02 
 
 
632 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.25 
 
 
619 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.36 
 
 
619 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.89 
 
 
578 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.16 
 
 
609 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.66 
 
 
610 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
623 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.3 
 
 
611 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
623 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
633 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 
623 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
623 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.33 
 
 
643 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.1 
 
 
596 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.96 
 
 
612 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
601 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.02 
 
 
555 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
620 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>