More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00740  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
578 aa  1105    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  47.55 
 
 
576 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.14 
 
 
597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.03 
 
 
616 aa  445  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  49.21 
 
 
566 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.2 
 
 
575 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.55 
 
 
586 aa  432  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  45.49 
 
 
619 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  43.86 
 
 
571 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
563 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
607 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  45.31 
 
 
603 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.81 
 
 
564 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.41 
 
 
571 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
554 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.15 
 
 
568 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
539 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  42.43 
 
 
565 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0439  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
553 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  42.27 
 
 
599 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
623 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
518 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
620 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  43.08 
 
 
623 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.8 
 
 
592 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.81 
 
 
611 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.82 
 
 
599 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.83 
 
 
562 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  44.5 
 
 
579 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.39 
 
 
615 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  43.79 
 
 
593 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.45 
 
 
566 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  40.35 
 
 
569 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  44.29 
 
 
613 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  44.63 
 
 
554 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.83 
 
 
552 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 
609 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.48 
 
 
596 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  44.14 
 
 
612 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.25 
 
 
619 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.86 
 
 
612 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.89 
 
 
592 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  45.29 
 
 
543 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.71 
 
 
640 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
611 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  45.29 
 
 
543 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.11 
 
 
531 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  43.63 
 
 
597 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 
642 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  45.29 
 
 
543 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.44 
 
 
640 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.1 
 
 
624 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  38.61 
 
 
578 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  42 
 
 
593 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.89 
 
 
592 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.27 
 
 
539 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.94 
 
 
626 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  40.63 
 
 
588 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
632 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  40.18 
 
 
543 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.85 
 
 
593 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  42.99 
 
 
537 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  37.59 
 
 
629 aa  379  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  42.11 
 
 
553 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.46 
 
 
617 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  44.32 
 
 
550 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  43.35 
 
 
537 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  43.26 
 
 
640 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.03 
 
 
619 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
611 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  42.91 
 
 
558 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  41.75 
 
 
550 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  44.03 
 
 
609 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  41.77 
 
 
629 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
548 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
615 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  41.74 
 
 
538 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.46 
 
 
547 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
571 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 
539 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  41.95 
 
 
531 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 
711 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  42.28 
 
 
552 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 
543 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.37 
 
 
536 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  42.98 
 
 
619 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.21 
 
 
610 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 
536 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  41.2 
 
 
525 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  42.22 
 
 
625 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  42.5 
 
 
611 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.8 
 
 
662 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.86 
 
 
620 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  42.75 
 
 
586 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
530 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.83 
 
 
633 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
623 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 
623 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
535 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  40.86 
 
 
568 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>