More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3482 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  76.7 
 
 
569 aa  839    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  76.58 
 
 
562 aa  834    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  100 
 
 
563 aa  1113    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  85.82 
 
 
566 aa  930    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  56.37 
 
 
631 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  52.84 
 
 
536 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  49.37 
 
 
543 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  53.21 
 
 
547 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  52.45 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  53.5 
 
 
534 aa  488  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  52.08 
 
 
559 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  52.08 
 
 
559 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  51.44 
 
 
579 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
582 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  51.24 
 
 
594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  48.45 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  49.54 
 
 
550 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.17 
 
 
516 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.31 
 
 
605 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.07 
 
 
593 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.64 
 
 
555 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.09 
 
 
555 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  45.65 
 
 
540 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.44 
 
 
583 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  44.36 
 
 
565 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  44.35 
 
 
544 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  43.09 
 
 
573 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
623 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  45.44 
 
 
573 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  42 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  42 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  41.7 
 
 
576 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.21 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.93 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  43.04 
 
 
571 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.31 
 
 
549 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
543 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  41.84 
 
 
623 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
593 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.45 
 
 
586 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  41.74 
 
 
571 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 
571 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
623 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
547 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  44.42 
 
 
540 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.68 
 
 
556 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 
539 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.86 
 
 
643 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  44.66 
 
 
540 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
539 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  44.66 
 
 
540 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
623 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  40.43 
 
 
566 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  46.44 
 
 
551 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  43.01 
 
 
558 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  44.07 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 
623 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  40.48 
 
 
624 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 
623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
623 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  44.46 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.4 
 
 
611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  44.37 
 
 
559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.19 
 
 
571 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.94 
 
 
531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.17 
 
 
530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  44.07 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  42.93 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.84 
 
 
609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40 
 
 
575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.81 
 
 
612 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 
623 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
571 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.46 
 
 
564 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  43.56 
 
 
539 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
544 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  42.81 
 
 
612 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.76 
 
 
572 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  44.83 
 
 
534 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.58 
 
 
599 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  41.18 
 
 
629 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  41.64 
 
 
630 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
547 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  44.42 
 
 
549 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.12 
 
 
534 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  41.47 
 
 
546 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  41.88 
 
 
534 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.53 
 
 
615 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
541 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  44.04 
 
 
555 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  45.01 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 
551 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.09 
 
 
627 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.93 
 
 
626 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  43.74 
 
 
543 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>