More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2143 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  75.84 
 
 		 551 aa  789    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  63.43 
 
 		 540 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  87.25 
 
 		 556 aa  947    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  62.78 
 
 		 547 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 		 540 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  64.13 
 
 		 544 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  73.79 
 
 		 551 aa  774    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  61.65 
 
 		 533 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  64.49 
 
 		 543 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  61.95 
 
 		 559 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  63.83 
 
 		 540 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  65.78 
 
 		 539 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 549 aa  1115    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  73.79 
 
 		 551 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  63.83 
 
 		 540 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  63.87 
 
 		 544 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 549 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  63.45 
 
 		 540 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  63.36 
 
 		 540 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  63.83 
 
 		 540 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  61.17 
 
 		 555 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  63.16 
 
 		 544 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  62.78 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  62.78 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1101  ABC transporter related  58.17 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  57.9 
 
 		 545 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  57.71 
 
 		 548 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  57.74 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  58.26 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  56.77 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  58.61 
 
 		 534 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  56.61 
 
 		 565 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  56.07 
 
 		 563 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  56.61 
 
 		 563 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  55.52 
 
 		 562 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2744  ABC transporter related  58.15 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  54.7 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  54.5 
 
 		 570 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  53.5 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  53.38 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  53.38 
 
 		 536 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  53.21 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  54.43 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  54.14 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  54.09 
 
 		 537 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  53.95 
 
 		 545 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  52.63 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  53.64 
 
 		 547 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  54.13 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 		 541 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  54.39 
 
 		 535 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  52.44 
 
 		 553 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  52.69 
 
 		 550 aa  534  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  53.02 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  53.26 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  53.37 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  54.32 
 
 		 539 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  54.3 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  53.45 
 
 		 537 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  53.5 
 
 		 531 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  53.45 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  53.66 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  54.61 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  51.7 
 
 		 538 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  52.43 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  52.92 
 
 		 524 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  51.33 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  53.16 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  53.8 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  53.18 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  55.3 
 
 		 545 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  52.36 
 
 		 533 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  53.08 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  53.12 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  52.93 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02110  fused predicted oligopeptide transporter subunits of ABC superfamilly: ATP-binding components  50.95 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 534 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  49.24 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  51.14 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  53.62 
 
 		 527 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  54.39 
 
 		 535 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  51.52 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  53.02 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02069  hypothetical protein  50.95 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.82 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>