More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1234 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1101  ABC transporter related  91.38 
 
 
545 aa  1024    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  100 
 
 
545 aa  1108    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  57.9 
 
 
549 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  56.7 
 
 
551 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  56.51 
 
 
551 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  56.51 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  55.6 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  55.6 
 
 
533 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  55.21 
 
 
544 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  55.21 
 
 
544 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  52.95 
 
 
544 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  53.79 
 
 
540 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 
559 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  53.59 
 
 
540 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  55.03 
 
 
544 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  53.79 
 
 
540 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  53.79 
 
 
540 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 
540 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  52.95 
 
 
543 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  54.06 
 
 
540 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  53.42 
 
 
540 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  54.7 
 
 
555 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  52.4 
 
 
539 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 
547 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
544 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  53.09 
 
 
563 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  53.41 
 
 
545 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.87 
 
 
549 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  54.3 
 
 
534 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 
548 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  53.23 
 
 
545 aa  535  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
549 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  51.02 
 
 
531 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  52.51 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  52.36 
 
 
565 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 
570 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 
536 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
536 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  49.17 
 
 
533 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  49.54 
 
 
534 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  48.8 
 
 
541 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  50 
 
 
562 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.8 
 
 
534 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47.88 
 
 
542 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50.55 
 
 
537 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2744  ABC transporter related  51.09 
 
 
544 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  47.99 
 
 
547 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.89 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
541 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  49.91 
 
 
545 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.52 
 
 
539 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.61 
 
 
542 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.33 
 
 
553 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  49.26 
 
 
537 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  48.07 
 
 
545 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  48.52 
 
 
539 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  48.16 
 
 
531 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
564 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
550 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  48.43 
 
 
533 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.17 
 
 
542 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  47.87 
 
 
543 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.79 
 
 
542 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  47.87 
 
 
543 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  48.07 
 
 
533 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.72 
 
 
545 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  49.27 
 
 
536 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  48.8 
 
 
542 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  47.51 
 
 
545 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  48.82 
 
 
537 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 
530 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  48.51 
 
 
543 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3318  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
529 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.561111  normal  0.65051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  48.8 
 
 
542 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  48.17 
 
 
535 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  46.88 
 
 
544 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
536 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  47.62 
 
 
536 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
545 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  49.45 
 
 
545 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  50 
 
 
545 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  46.88 
 
 
537 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  49.72 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  49.08 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2478  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.51 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.91 
 
 
536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1467  ABC transporter related  47.6 
 
 
529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000937636  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0778  ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.88 
 
 
525 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.04 
 
 
571 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  47.79 
 
 
532 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.7 
 
 
543 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>