More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2744 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  70.39 
 
 		 545 aa  731    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2744  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1074    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  68.34 
 
 		 565 aa  700    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  70.47 
 
 		 563 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  68.08 
 
 		 563 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  70.76 
 
 		 545 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  73.46 
 
 		 534 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  68.27 
 
 		 562 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  69.57 
 
 		 570 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 544 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  58.74 
 
 		 548 aa  598  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  60.41 
 
 		 556 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  58.21 
 
 		 539 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  57.96 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  58.15 
 
 		 543 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  59.3 
 
 		 559 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  59.85 
 
 		 551 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  58.56 
 
 		 555 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  57.2 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  57.33 
 
 		 540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  58.7 
 
 		 549 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  57.51 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  57.2 
 
 		 540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  57.51 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  59.12 
 
 		 547 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  59.41 
 
 		 544 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  59.41 
 
 		 544 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  57.33 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  59.23 
 
 		 544 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  58.79 
 
 		 551 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  58.29 
 
 		 551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  54.96 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 564 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  53.59 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  53.22 
 
 		 539 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1101  ABC transporter related  52.98 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  53.04 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  51.45 
 
 		 545 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  53.35 
 
 		 545 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  52.31 
 
 		 537 aa  511  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  49.36 
 
 		 534 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  49.82 
 
 		 536 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  51.66 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  52.31 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  50.93 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  51.31 
 
 		 527 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  49.82 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  51.36 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  50.37 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  50.45 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  51.57 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  50.28 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  51.29 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  49.64 
 
 		 542 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  52.31 
 
 		 532 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  51.74 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  52 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  50.83 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  52.21 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  51.2 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  52.02 
 
 		 542 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  51.2 
 
 		 543 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  52.21 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  50 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.71 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.13 
 
 		 536 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  51.1 
 
 		 537 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  51 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.63 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  49.07 
 
 		 527 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  51.11 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  50.74 
 
 		 524 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  50.46 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  50.36 
 
 		 545 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  51.11 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  49.17 
 
 		 529 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  51.18 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  50.56 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 		 525 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  50 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  52.04 
 
 		 539 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  49.91 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  49.54 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  49.54 
 
 		 533 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.99 
 
 		 534 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1477  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.086834  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2456  glutathione import ATP-binding protein GsiA  48.98 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000644784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2413  glutathione import ATP-binding protein GsiA  48.98 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.137702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>