More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2014 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1061    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  70.13 
 
 		 570 aa  718    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  68.83 
 
 		 563 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  72.25 
 
 		 565 aa  735    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  79.96 
 
 		 563 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2744  ABC transporter related  73.46 
 
 		 544 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  74.06 
 
 		 545 aa  752    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  73.87 
 
 		 545 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  67.1 
 
 		 562 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  57.71 
 
 		 548 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  58.44 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  58.92 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  58.33 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  58.33 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  58.33 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  57.49 
 
 		 544 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  58.61 
 
 		 549 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 551 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  57.96 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  56.37 
 
 		 544 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  56.93 
 
 		 539 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  56.37 
 
 		 540 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  57.68 
 
 		 556 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  57.28 
 
 		 551 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  56.26 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  56.55 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  55.81 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  55.99 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  55.99 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  56.3 
 
 		 533 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  55.24 
 
 		 543 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  57.09 
 
 		 551 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  55.99 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1234  ABC transporter related  54.3 
 
 		 545 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  56.26 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1101  ABC transporter related  54.3 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  49.91 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  49.91 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  49.81 
 
 		 534 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  50.75 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  50.84 
 
 		 539 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  50.65 
 
 		 539 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  51.69 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  50.65 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  51.21 
 
 		 537 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50.93 
 
 		 537 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  50.56 
 
 		 542 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  49.54 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  48.43 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  50.74 
 
 		 537 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  50.74 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  50.94 
 
 		 537 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  50.65 
 
 		 542 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.95 
 
 		 536 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  50.84 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  51.19 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  50 
 
 		 537 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  51.87 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  49.45 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.63 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.44 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  49.44 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  50.19 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  50.65 
 
 		 542 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.91 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  48.23 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  49.72 
 
 		 543 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.5 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  50.93 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 541 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  49.25 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  50.28 
 
 		 530 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  49.91 
 
 		 543 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  48.61 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  48.89 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  50.28 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  49.72 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  49.72 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  48.98 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  48.15 
 
 		 542 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  49.25 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  49.07 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 545 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.79 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  49.54 
 
 		 543 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  48.79 
 
 		 536 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.21 
 
 		 555 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.87 
 
 		 534 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  49.63 
 
 		 543 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  49.54 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  47.31 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>