More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2533 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 582 aa  1130    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  60.79 
 
 		 579 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  56.59 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  57.32 
 
 		 631 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  58.6 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  52.22 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  51.23 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  54.14 
 
 		 550 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  50.46 
 
 		 543 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  52.83 
 
 		 563 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  50.9 
 
 		 569 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  54.89 
 
 		 559 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  54.89 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  54.89 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  49.91 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  52.71 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  44.89 
 
 		 543 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  46.96 
 
 		 619 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  45.95 
 
 		 549 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  45.24 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.91 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.26 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  41.61 
 
 		 629 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.95 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.66 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  46.38 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.77 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.06 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.88 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.95 
 
 		 593 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  46.34 
 
 		 538 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  49.82 
 
 		 551 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.09 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.36 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.4 
 
 		 586 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.9 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.83 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.68 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  44.61 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  45.39 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  44.46 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  43.35 
 
 		 571 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.37 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  48.37 
 
 		 548 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 620 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  44.17 
 
 		 545 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.81 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  44.14 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.22 
 
 		 611 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  42 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.99 
 
 		 537 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 611 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 611 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 536 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 		 545 aa  412  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 		 615 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  40.72 
 
 		 619 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  44.32 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  39.5 
 
 		 564 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 619 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 536 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.41 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40.3 
 
 		 627 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  46.4 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  43.59 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  41.88 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.99 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 609 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.88 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  44.24 
 
 		 542 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.15 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 		 677 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  42.45 
 
 		 541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  45.36 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  41.73 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  42.78 
 
 		 611 aa  405  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.32 
 
 		 661 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 563 aa  405  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.78 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  45.82 
 
 		 579 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.14 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  43.41 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.55 
 
 		 599 aa  405  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  44.8 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  46.27 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  42.39 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  42.29 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.57 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.44 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>