More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2259 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.77 
 
 
725 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  59.31 
 
 
686 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.55 
 
 
749 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  58.76 
 
 
718 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.78 
 
 
711 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  82.16 
 
 
611 aa  984    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  82.16 
 
 
611 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.25 
 
 
611 aa  1038    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  76.68 
 
 
612 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.08 
 
 
725 aa  700    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  82.32 
 
 
611 aa  985    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
611 aa  1204    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.59 
 
 
677 aa  633  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.14 
 
 
756 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.86 
 
 
736 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  53.9 
 
 
712 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.18 
 
 
725 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.41 
 
 
629 aa  586  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  52.58 
 
 
706 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00302442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3276  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.81 
 
 
688 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.54 
 
 
599 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.45 
 
 
674 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.63 
 
 
690 aa  503  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.14 
 
 
676 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
665 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.28 
 
 
615 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.72 
 
 
597 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.7 
 
 
611 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  46.9 
 
 
606 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  45.98 
 
 
628 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.68 
 
 
658 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.2 
 
 
699 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.81 
 
 
617 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  44.12 
 
 
611 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.44 
 
 
703 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
744 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.16 
 
 
611 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.32 
 
 
613 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
695 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
905 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  40.6 
 
 
602 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  40.6 
 
 
603 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
659 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.04 
 
 
612 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.11 
 
 
680 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  43.04 
 
 
610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.89 
 
 
708 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.02 
 
 
586 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.44 
 
 
632 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 
642 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.52 
 
 
615 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  44.68 
 
 
609 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.88 
 
 
601 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.19 
 
 
640 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.25 
 
 
619 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 
625 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.87 
 
 
640 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.96 
 
 
571 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.36 
 
 
671 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  43.86 
 
 
593 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
609 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
633 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.41 
 
 
629 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
633 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
625 aa  442  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
629 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 
623 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.11 
 
 
612 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
623 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  47.28 
 
 
579 aa  439  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.82 
 
 
623 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
623 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.11 
 
 
612 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
623 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 
571 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
620 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
631 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
623 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 
632 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
623 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.95 
 
 
623 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
623 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.59 
 
 
643 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.6 
 
 
630 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
629 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.25 
 
 
633 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.95 
 
 
610 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  44.68 
 
 
633 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.04 
 
 
662 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  42.86 
 
 
624 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.76 
 
 
619 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  40.92 
 
 
571 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 
623 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.23 
 
 
593 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  40.13 
 
 
583 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>