More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3476 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  100 
 
 		 594 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  56.5 
 
 		 631 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  53.56 
 
 		 569 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  52.91 
 
 		 566 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  53.08 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  54.99 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  52.06 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  56.88 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  50.46 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  53.76 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  53.58 
 
 		 559 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  53.58 
 
 		 559 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  52.66 
 
 		 579 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 582 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  50.73 
 
 		 562 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.51 
 
 		 605 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  51.91 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.83 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.08 
 
 		 593 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.16 
 
 		 547 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.58 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 593 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  43.12 
 
 		 545 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.19 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  44.4 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  45.44 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.26 
 
 		 661 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  43.79 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  44.24 
 
 		 588 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.79 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  40.32 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  45.63 
 
 		 565 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 		 711 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.6 
 
 		 629 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  44.55 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  45.09 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  45.27 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  43.68 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  43.94 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  46.18 
 
 		 619 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.93 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.29 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  44.21 
 
 		 560 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.53 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  43.35 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  43.04 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.49 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  47.02 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  45.86 
 
 		 588 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  39.43 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.27 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  44.44 
 
 		 544 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  39.12 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  45.57 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.92 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.53 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  42.13 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.3 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.91 
 
 		 616 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.48 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  47.58 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  44.28 
 
 		 659 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  46.67 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  45.29 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.01 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 		 543 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.56 
 
 		 571 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.65 
 
 		 564 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  44.77 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.97 
 
 		 626 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.93 
 
 		 628 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  39.61 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  38.89 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  38.89 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  38.88 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  43.88 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  44.75 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  43.43 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.82 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  46.85 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  44.06 
 
 		 551 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  43.97 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  43.76 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.77 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  43.97 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  43.67 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  43.75 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>