More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 516 aa  982    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  56.87 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  53.54 
 
 		 536 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  54.86 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  52.83 
 
 		 579 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  49.45 
 
 		 563 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  48.9 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  51.54 
 
 		 534 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  47.52 
 
 		 569 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.79 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  51.55 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  50.1 
 
 		 559 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  49.63 
 
 		 582 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  50.29 
 
 		 559 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  50.29 
 
 		 559 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  47.31 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  46.85 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  50.46 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.73 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.56 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  45.54 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.94 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.83 
 
 		 555 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  48.05 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.87 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.94 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  42.88 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  41.21 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.16 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  47.05 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.1 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.61 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  48.6 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  44.65 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3501  ABC transporter related  46.1 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.480993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.7 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.31 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 594 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.73 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  42.04 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  42.67 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.38 
 
 		 643 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.52 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  43.71 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  44.36 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.5 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  43.83 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  44.61 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  46.01 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  45.8 
 
 		 530 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  41.89 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  43.77 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.53 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  44.42 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  44.57 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  42.57 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  41.75 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  42.31 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  43.84 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  42.75 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  42.48 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  42.78 
 
 		 531 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  43.48 
 
 		 543 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  44.81 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  43.58 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  44.81 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.42 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.08 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  43.45 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  42.11 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  42.64 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  41.56 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.84 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  42.69 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  41.26 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  43.77 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  42.86 
 
 		 631 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  42.1 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  43.5 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  42.67 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  42.67 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  42.83 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.66 
 
 		 661 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  42.44 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  44.91 
 
 		 597 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 571 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  43.77 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>