More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  100 
 
 
562 aa  1110    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  54.38 
 
 
579 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
582 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  51.81 
 
 
631 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  47.27 
 
 
566 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  50.83 
 
 
536 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  49.17 
 
 
543 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  48.45 
 
 
563 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  47.15 
 
 
569 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  52.98 
 
 
547 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  46.81 
 
 
562 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  51.02 
 
 
550 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  48.91 
 
 
559 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  48.73 
 
 
559 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  48.73 
 
 
559 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  50.64 
 
 
594 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.32 
 
 
546 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  46.07 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.45 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.73 
 
 
549 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.08 
 
 
605 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  43.9 
 
 
540 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  43.49 
 
 
588 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  43.22 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.17 
 
 
549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.31 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  43.69 
 
 
539 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
536 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.11 
 
 
573 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  43.27 
 
 
539 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.6 
 
 
534 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
536 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  41.74 
 
 
558 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  41.91 
 
 
576 aa  402  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
571 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
573 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  42.96 
 
 
539 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  42.28 
 
 
593 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  43.54 
 
 
545 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  42.8 
 
 
538 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.48 
 
 
571 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.65 
 
 
643 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  42.03 
 
 
539 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  38.65 
 
 
571 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.92 
 
 
628 aa  399  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  43.02 
 
 
541 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  42.42 
 
 
552 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  40.56 
 
 
565 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  42.42 
 
 
552 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  39.54 
 
 
543 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  40.11 
 
 
572 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.98 
 
 
578 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  42.67 
 
 
531 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.53 
 
 
564 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  40.93 
 
 
611 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  41.28 
 
 
530 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.97 
 
 
611 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  41.22 
 
 
571 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.79 
 
 
661 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  42.05 
 
 
561 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 
536 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  44.24 
 
 
585 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  39.89 
 
 
530 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
544 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  40.91 
 
 
552 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
539 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 
625 aa  392  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  43.07 
 
 
546 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.54 
 
 
671 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  35.78 
 
 
564 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  39.89 
 
 
530 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  39.86 
 
 
570 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  41.68 
 
 
535 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.77 
 
 
575 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.82 
 
 
617 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  40.51 
 
 
536 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
620 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
565 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  40.67 
 
 
583 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  40.6 
 
 
631 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
593 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  39.86 
 
 
610 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  37.06 
 
 
566 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  42 
 
 
537 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.14 
 
 
612 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  40.95 
 
 
533 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  40.18 
 
 
573 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  41.55 
 
 
588 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  40.29 
 
 
525 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  42.36 
 
 
558 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.75 
 
 
611 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  42.22 
 
 
544 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.2 
 
 
629 aa  383  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  40.99 
 
 
630 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 
547 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  43.68 
 
 
544 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  43.61 
 
 
534 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  40.75 
 
 
611 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>