More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2764 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  100 
 
 		 631 aa  1194    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  54.63 
 
 		 566 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  56.37 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  54.11 
 
 		 569 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  53.52 
 
 		 562 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  57.64 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 582 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 534 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  53.06 
 
 		 543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  55.69 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  58.45 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  55.52 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  55.52 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  51.95 
 
 		 579 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  51.99 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  51.59 
 
 		 550 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  53.08 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.83 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  45.26 
 
 		 549 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  49.39 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.82 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  41.61 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.83 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  44.16 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  44.98 
 
 		 619 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  41.54 
 
 		 543 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  43.27 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  45.53 
 
 		 593 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  45.08 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.23 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.66 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  45.02 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  45.49 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  47.83 
 
 		 534 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.25 
 
 		 615 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  48.83 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 536 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.77 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  45.37 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.06 
 
 		 534 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  47.08 
 
 		 543 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.03 
 
 		 586 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  44.6 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  48.32 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  44.6 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  41.91 
 
 		 561 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  46.9 
 
 		 543 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  47.05 
 
 		 565 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.72 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  46.74 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 		 545 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.26 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  43.49 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.97 
 
 		 629 aa  412  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.03 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 620 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.45 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  43.24 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.14 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.01 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.55 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  45.94 
 
 		 593 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 		 545 aa  412  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  45.93 
 
 		 624 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.01 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  44.02 
 
 		 588 aa  412  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  45.73 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  47.83 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.33 
 
 		 613 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  45.7 
 
 		 543 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  46.04 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  44.79 
 
 		 624 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.72 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  45.34 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  43.06 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 		 674 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.05 
 
 		 643 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.08 
 
 		 611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 		 559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  45.82 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.12 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  45.1 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  45.01 
 
 		 602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  43.96 
 
 		 557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  44.09 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>