More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3501 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3501  ABC transporter related  100 
 
 		 549 aa  1020    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.480993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  45.11 
 
 		 566 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  44.92 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  48.07 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  46.17 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  48.4 
 
 		 631 aa  392  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.23 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  42.22 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  42.86 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.28 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  44.18 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  44.16 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  44.16 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  47.84 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  46.88 
 
 		 594 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3343  ABC transporter related  40.6 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0875705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  41.17 
 
 		 624 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.82 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  41.48 
 
 		 603 aa  346  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.85 
 
 		 605 aa  346  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227418  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  39.34 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  38.98 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  41.46 
 
 		 624 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  38.49 
 
 		 549 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 554 aa  343  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  41.32 
 
 		 565 aa  342  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.72 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  38.5 
 
 		 550 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 544 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  37.99 
 
 		 554 aa  339  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  37.79 
 
 		 570 aa  339  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  41.51 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.38 
 
 		 573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.13 
 
 		 540 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  36.41 
 
 		 561 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  40.95 
 
 		 534 aa  336  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.68 
 
 		 571 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  39.71 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.2 
 
 		 583 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  38.9 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  40.04 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.48 
 
 		 628 aa  334  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.99 
 
 		 575 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  36.07 
 
 		 530 aa  332  9e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  39.85 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  38.39 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  39.53 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  38.28 
 
 		 542 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  40.29 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 601 aa  332  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.65 
 
 		 577 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  39.02 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 563 aa  331  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  37.26 
 
 		 611 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.59 
 
 		 568 aa  331  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  37.12 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 565 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  38.69 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  39.26 
 
 		 533 aa  330  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  37.75 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  36.86 
 
 		 611 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  40.04 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  37.77 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  37.34 
 
 		 555 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 		 548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  38.13 
 
 		 611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  40.04 
 
 		 531 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.04 
 
 		 615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  40.59 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.51 
 
 		 583 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  39.85 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  35.48 
 
 		 547 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  41.22 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 539 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  41.23 
 
 		 539 aa  326  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  41.35 
 
 		 562 aa  326  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  39.96 
 
 		 534 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  37.85 
 
 		 545 aa  326  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  40.07 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  38.01 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  40.34 
 
 		 571 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  39.36 
 
 		 545 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  42.11 
 
 		 551 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.16 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  33.28 
 
 		 609 aa  325  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  39.33 
 
 		 557 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  37.85 
 
 		 545 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  37.28 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  38.11 
 
 		 556 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.3 
 
 		 586 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  37.26 
 
 		 629 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  35.21 
 
 		 565 aa  324  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.59 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  41.56 
 
 		 530 aa  324  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>