More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3166 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  100 
 
 
516 aa  977    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5268  ABC transporter, ATP-binding protein  52.9 
 
 
554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0920443  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  46.15 
 
 
573 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  50.95 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  47.48 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  43.91 
 
 
542 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.98 
 
 
545 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  47.35 
 
 
553 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
544 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  47.61 
 
 
541 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  46.37 
 
 
550 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  47.55 
 
 
565 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
518 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  42.21 
 
 
547 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  45.97 
 
 
552 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  45.4 
 
 
530 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.41 
 
 
619 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
573 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  46.02 
 
 
576 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  46.48 
 
 
552 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  47.57 
 
 
587 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 
539 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.95 
 
 
612 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  43.84 
 
 
611 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  44.1 
 
 
571 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  45.75 
 
 
539 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  48.14 
 
 
534 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.83 
 
 
611 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  48.04 
 
 
540 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  44.56 
 
 
594 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  43.82 
 
 
541 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  45.77 
 
 
552 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.99 
 
 
568 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  46.13 
 
 
552 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  45.69 
 
 
543 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.91 
 
 
548 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  47.26 
 
 
538 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.2 
 
 
609 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  46.53 
 
 
533 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  47.78 
 
 
554 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  45.76 
 
 
552 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.7 
 
 
546 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  43.54 
 
 
627 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 
632 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  47.2 
 
 
550 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.28 
 
 
539 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  42.36 
 
 
629 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  42.88 
 
 
611 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.37 
 
 
583 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.51 
 
 
522 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  44.4 
 
 
561 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  44.78 
 
 
606 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  46.99 
 
 
600 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  44.91 
 
 
566 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  45.37 
 
 
544 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 
564 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.81 
 
 
539 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  40.14 
 
 
583 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  43.77 
 
 
593 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  45.9 
 
 
569 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.25 
 
 
611 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  46.27 
 
 
597 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  45.72 
 
 
538 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  44.51 
 
 
546 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3807  ABC transporter related  44.38 
 
 
568 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  hitchhiker  0.00204057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  47.98 
 
 
563 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  43.97 
 
 
554 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  44.77 
 
 
613 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.39 
 
 
586 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  47.26 
 
 
534 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.68 
 
 
615 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
534 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  47.53 
 
 
540 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.41 
 
 
548 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  48.46 
 
 
534 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  46 
 
 
543 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
562 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  41.59 
 
 
631 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.22 
 
 
643 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.75 
 
 
542 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.57 
 
 
590 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.41 
 
 
549 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.94 
 
 
555 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  41.77 
 
 
629 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  41.81 
 
 
597 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  45.06 
 
 
582 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  47.27 
 
 
532 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  44.15 
 
 
540 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  45.3 
 
 
544 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  43.51 
 
 
565 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  46.08 
 
 
613 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40 
 
 
578 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  43.33 
 
 
569 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  43.35 
 
 
531 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.49 
 
 
630 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.07 
 
 
599 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.53 
 
 
556 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  44.02 
 
 
542 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  46.06 
 
 
550 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>