More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5268 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5268  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
554 aa  1074    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0920443  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
669 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3344  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 
609 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2121  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
516 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
615 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.86 
 
 
699 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42 
 
 
686 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
690 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 
611 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  43.23 
 
 
658 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
695 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 
677 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
711 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
611 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  39.55 
 
 
602 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  39.21 
 
 
603 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.64 
 
 
611 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
691 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
674 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
611 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
611 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  44.27 
 
 
536 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
669 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.219449  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  42.52 
 
 
612 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  42.31 
 
 
628 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 
744 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.18 
 
 
538 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.31 
 
 
712 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  40.03 
 
 
583 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
905 aa  364  3e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 
725 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.97 
 
 
642 aa  362  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  40.29 
 
 
718 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
736 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1843  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  43.61 
 
 
665 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
665 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.508621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1824  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
665 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
659 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  39.62 
 
 
586 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  44.13 
 
 
559 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.33 
 
 
571 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  42.66 
 
 
579 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  39.97 
 
 
629 aa  359  6e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 
708 aa  359  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  41.42 
 
 
543 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 
703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  43.96 
 
 
559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  43.96 
 
 
559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  42.56 
 
 
540 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
571 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
680 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  38.24 
 
 
522 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3178  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 
727 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00139803 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 
571 aa  355  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.1 
 
 
583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
725 aa  354  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  40.35 
 
 
569 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  40.46 
 
 
562 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.67 
 
 
671 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
544 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
594 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  36.64 
 
 
566 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
620 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.07 
 
 
619 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  41.04 
 
 
566 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.64 
 
 
725 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  42.86 
 
 
659 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  38.3 
 
 
571 aa  350  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  43.69 
 
 
565 aa  349  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
573 aa  349  6e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  39.69 
 
 
569 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.41 
 
 
578 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.85 
 
 
568 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  41.17 
 
 
557 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  41.17 
 
 
557 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
539 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3276  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 
688 aa  347  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  41.09 
 
 
619 aa  347  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  41.26 
 
 
545 aa  347  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
600 aa  346  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
593 aa  346  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.08 
 
 
626 aa  346  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
665 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.17 
 
 
643 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  41.59 
 
 
552 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0454  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
603 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.40256  normal  0.0333961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  37.01 
 
 
552 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  41.8 
 
 
563 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  38.92 
 
 
611 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 
547 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.62 
 
 
749 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.91 
 
 
756 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  42.25 
 
 
547 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  39.12 
 
 
624 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.95 
 
 
706 aa  343  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00302442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
594 aa  343  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  39.75 
 
 
543 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00740  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.01 
 
 
578 aa  343  5.999999999999999e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 
701 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0332392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>