More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3603 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  100 
 
 		 518 aa  989    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  49.45 
 
 		 564 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  48.16 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.95 
 
 		 568 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  50.29 
 
 		 563 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.86 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.96 
 
 		 576 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.99 
 
 		 616 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  45.88 
 
 		 619 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  47.57 
 
 		 586 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  48.28 
 
 		 603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.17 
 
 		 565 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  50.18 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 607 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  43.76 
 
 		 569 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.37 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.44 
 
 		 597 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 545 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.2 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.92 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.37 
 
 		 545 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.52 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  46.39 
 
 		 538 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.46 
 
 		 543 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  44.94 
 
 		 593 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  46.38 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.47 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.2 
 
 		 564 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  46.15 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  45.17 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  45.81 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  48.51 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.31 
 
 		 613 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.16 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  49.91 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.42 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.39 
 
 		 617 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  49.07 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  46.32 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.89 
 
 		 568 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.08 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  44.47 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.81 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  45.86 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  42.59 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  46.1 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  44.69 
 
 		 606 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  47.99 
 
 		 543 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  46.62 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.47 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  44.47 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  47.61 
 
 		 543 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  46.62 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  45.86 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  46.44 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.34 
 
 		 619 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.81 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.73 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.01 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  47.45 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  45.19 
 
 		 537 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  48.76 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  47 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 550 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  48.62 
 
 		 539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  48.36 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  48.22 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  45.76 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.07 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  45.77 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  46.5 
 
 		 585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  45.56 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.64 
 
 		 555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  45.59 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.07 
 
 		 542 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  48.36 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  48.36 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  46.08 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  45.79 
 
 		 527 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  44.23 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  45.58 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  45.16 
 
 		 554 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  45.58 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  45.58 
 
 		 533 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  46.11 
 
 		 547 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.83 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  43.23 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  44.72 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  44.11 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  47.45 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.1 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  42.88 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>