More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3806 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  100 
 
 
681 aa  1332    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  77.71 
 
 
682 aa  1001    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  85.92 
 
 
709 aa  1094    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  77.86 
 
 
682 aa  997    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  69.53 
 
 
697 aa  868    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  77.86 
 
 
682 aa  997    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  45.95 
 
 
675 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
944 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.2 
 
 
810 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.06 
 
 
458 aa  165  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.98 
 
 
568 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.8 
 
 
770 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 
491 aa  157  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.03 
 
 
571 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.19 
 
 
510 aa  157  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  31.31 
 
 
533 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  29.39 
 
 
534 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.1 
 
 
647 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.24 
 
 
456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.1 
 
 
497 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.04 
 
 
541 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 
509 aa  144  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.69 
 
 
764 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  30.43 
 
 
544 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  29.27 
 
 
481 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  28.49 
 
 
548 aa  140  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  30.99 
 
 
549 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  30.28 
 
 
539 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  29.17 
 
 
613 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  30.74 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  30.08 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  29.35 
 
 
539 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  30.74 
 
 
624 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  30.52 
 
 
624 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  31.98 
 
 
491 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  31.94 
 
 
546 aa  134  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.34 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  31.44 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  31.1 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  27.22 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.95 
 
 
576 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  29.15 
 
 
608 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  28 
 
 
543 aa  132  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  31.1 
 
 
621 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  30.32 
 
 
538 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  31.85 
 
 
547 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  28.9 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  30 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 
553 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.77 
 
 
464 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  26.84 
 
 
500 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 
536 aa  130  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.51 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  27.57 
 
 
534 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.6 
 
 
478 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.21 
 
 
516 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  29 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.68 
 
 
344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  31.34 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  28.91 
 
 
477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  29.53 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.98 
 
 
489 aa  129  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.47 
 
 
450 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.31 
 
 
614 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  30.06 
 
 
536 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  31.87 
 
 
547 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 
536 aa  127  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  28.94 
 
 
557 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
539 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  29.11 
 
 
614 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  28.07 
 
 
563 aa  127  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  29.92 
 
 
550 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  28.76 
 
 
613 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  27.29 
 
 
543 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  31.94 
 
 
534 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  29.31 
 
 
561 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  29.76 
 
 
540 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  26.67 
 
 
469 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  30.21 
 
 
551 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  29.54 
 
 
546 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5586  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.27 
 
 
511 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249808  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  35.02 
 
 
288 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.37 
 
 
501 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.36 
 
 
267 aa  124  4e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2131  ABC transporter related  29.48 
 
 
565 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  27.1 
 
 
544 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  28.52 
 
 
543 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  29.82 
 
 
558 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  28.28 
 
 
555 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.34 
 
 
552 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  29.08 
 
 
588 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  29.78 
 
 
538 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  28.22 
 
 
542 aa  124  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  28.57 
 
 
536 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  38.5 
 
 
266 aa  124  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
428 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  30.94 
 
 
573 aa  123  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.92 
 
 
490 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>