More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2730 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  65.43 
 
 
697 aa  827    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  100 
 
 
709 aa  1392    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  76.83 
 
 
682 aa  979    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  85.92 
 
 
681 aa  1079    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  76.98 
 
 
682 aa  986    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  76.83 
 
 
682 aa  979    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
675 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
944 aa  347  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.42 
 
 
810 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.58 
 
 
458 aa  161  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.46 
 
 
568 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  27.77 
 
 
568 aa  153  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 
489 aa  152  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.69 
 
 
647 aa  150  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.31 
 
 
510 aa  150  9e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  31.44 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  30.77 
 
 
456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 
770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.59 
 
 
571 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.52 
 
 
502 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.63 
 
 
541 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.42 
 
 
495 aa  144  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
516 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  27.77 
 
 
555 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  28.21 
 
 
548 aa  140  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  31.56 
 
 
546 aa  139  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.04 
 
 
495 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  29.68 
 
 
533 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  28.43 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.87 
 
 
464 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  29.07 
 
 
544 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  27.45 
 
 
534 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  27.48 
 
 
613 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  29.5 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.36 
 
 
764 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  30.74 
 
 
549 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  31.58 
 
 
491 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.83 
 
 
481 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  31.23 
 
 
546 aa  134  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  30.36 
 
 
471 aa  133  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  28.45 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  28.17 
 
 
536 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  30.83 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.13 
 
 
576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.13 
 
 
566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  28.45 
 
 
539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
482 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.93 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  29.07 
 
 
563 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  23.62 
 
 
568 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  30.41 
 
 
624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  29.82 
 
 
624 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.57 
 
 
497 aa  130  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  31.69 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  32.28 
 
 
545 aa  130  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.84 
 
 
478 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  29.82 
 
 
624 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  30.41 
 
 
621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  29.82 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.84 
 
 
548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  27.8 
 
 
581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  30.64 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.75 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  27.25 
 
 
469 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  28.45 
 
 
588 aa  128  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 
546 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
428 aa  127  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  23.05 
 
 
568 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  28.63 
 
 
614 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  29.53 
 
 
542 aa  127  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  28.69 
 
 
539 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  29.55 
 
 
546 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  31.05 
 
 
547 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  29.53 
 
 
543 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.01 
 
 
628 aa  126  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  32.43 
 
 
551 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25.38 
 
 
593 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  27.54 
 
 
542 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  27.42 
 
 
500 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  29.47 
 
 
544 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 
613 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  27.62 
 
 
541 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  28.83 
 
 
565 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.52 
 
 
450 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.58 
 
 
491 aa  125  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  27.55 
 
 
585 aa  125  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.49 
 
 
552 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.3 
 
 
516 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
539 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  28.01 
 
 
565 aa  125  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  29.98 
 
 
557 aa  125  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.17 
 
 
611 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.22 
 
 
614 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
267 aa  124  5e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  31.68 
 
 
542 aa  124  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  29.08 
 
 
540 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  28.15 
 
 
555 aa  124  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  29.15 
 
 
613 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  28.42 
 
 
546 aa  124  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>