More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2487 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  100 
 
 		 944 aa  1804    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  40.83 
 
 		 682 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 697 aa  364  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  40.83 
 
 		 682 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  40.83 
 
 		 682 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 		 681 aa  346  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  40.71 
 
 		 709 aa  343  8e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 675 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 770 aa  203  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.6 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 568 aa  160  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  33.87 
 
 		 571 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.49 
 
 		 647 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  29.83 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.33 
 
 		 510 aa  144  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.26 
 
 		 500 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.42 
 
 		 464 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 482 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.02 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.29 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  33.62 
 
 		 512 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.66 
 
 		 553 aa  139  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.26 
 
 		 495 aa  139  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.92 
 
 		 509 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.15 
 
 		 469 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.01 
 
 		 557 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  30.63 
 
 		 587 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  25.79 
 
 		 574 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.3 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.13 
 
 		 456 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  37.38 
 
 		 266 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  34.6 
 
 		 408 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 		 470 aa  133  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  29.11 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  28.75 
 
 		 493 aa  133  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.73 
 
 		 1091 aa  132  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.04 
 
 		 464 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 541 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  32.79 
 
 		 517 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  30.74 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  30.56 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  37.81 
 
 		 262 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.36 
 
 		 534 aa  129  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  31.95 
 
 		 451 aa  129  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  29.44 
 
 		 507 aa  129  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  31.21 
 
 		 539 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  32.9 
 
 		 539 aa  128  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.84 
 
 		 548 aa  128  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.06 
 
 		 558 aa  127  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  30.49 
 
 		 546 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  30.11 
 
 		 455 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.48 
 
 		 478 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  31.89 
 
 		 483 aa  127  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  31.82 
 
 		 491 aa  126  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.16 
 
 		 493 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.52 
 
 		 490 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.22 
 
 		 512 aa  125  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  32.22 
 
 		 538 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  30.74 
 
 		 582 aa  124  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  28.17 
 
 		 555 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  29.49 
 
 		 546 aa  123  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  29.49 
 
 		 454 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  28.17 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.94 
 
 		 481 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.41 
 
 		 811 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  29.05 
 
 		 558 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.38 
 
 		 641 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.75 
 
 		 526 aa  121  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.82 
 
 		 497 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  25.85 
 
 		 501 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  26.84 
 
 		 555 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  29.38 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  28.32 
 
 		 543 aa  120  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  39.59 
 
 		 283 aa  119  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.13 
 
 		 457 aa  119  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  27.51 
 
 		 471 aa  119  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  28.54 
 
 		 550 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  29.56 
 
 		 527 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  27.91 
 
 		 498 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.2 
 
 		 530 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.75 
 
 		 550 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  28.54 
 
 		 458 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  27.24 
 
 		 561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0500  ABC transporter related  29.78 
 
 		 533 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  28.66 
 
 		 501 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2344  methyl coenzyme M reductase system, component A2  27.52 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.221384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 293 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  29.4 
 
 		 960 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.05 
 
 		 536 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.29 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  27.37 
 
 		 498 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 293 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 293 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  37.62 
 
 		 281 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 293 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 		 281 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  27.03 
 
 		 509 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>