More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12349 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3806  ABC transporter-related protein  69.53 
 
 		 681 aa  847    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279274  normal  0.590434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3442  ABC transporter related  70.97 
 
 		 682 aa  887    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3431  ABC transporter related  71.11 
 
 		 682 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12349  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 697 aa  1372    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.76613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2730  ABC transporter related  65.43 
 
 		 709 aa  815    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3494  ABC transporter related  71.11 
 
 		 682 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3221  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 944 aa  350  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.92 
 
 		 810 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.01 
 
 		 568 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 770 aa  164  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.45 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.63 
 
 		 568 aa  156  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.55 
 
 		 548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  26.55 
 
 		 574 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30 
 
 		 628 aa  152  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.66 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.59 
 
 		 571 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.65 
 
 		 576 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.95 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  28.6 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  31.82 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  26.91 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  32.01 
 
 		 449 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.31 
 
 		 593 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  28.71 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  29.88 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  31.28 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  29.12 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  31.68 
 
 		 624 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  29.74 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  30.47 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  31.68 
 
 		 624 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  31.3 
 
 		 545 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  31.47 
 
 		 624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  29.75 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  30.04 
 
 		 534 aa  137  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  32.05 
 
 		 624 aa  137  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  32.05 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  30.42 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  30.21 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  25.93 
 
 		 579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  25.82 
 
 		 569 aa  133  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  34.47 
 
 		 408 aa  133  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  26.72 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  30.55 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  29.46 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  29.21 
 
 		 549 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  28.83 
 
 		 542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  28.9 
 
 		 566 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 544 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  27.15 
 
 		 572 aa  130  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  27.62 
 
 		 530 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  29.05 
 
 		 530 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  28.42 
 
 		 551 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  29.68 
 
 		 538 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.17 
 
 		 512 aa  130  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  45.29 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  29.09 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  29.74 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  38.5 
 
 		 266 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.33 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  29.08 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  28.69 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.77 
 
 		 467 aa  129  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  25.28 
 
 		 565 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.79 
 
 		 552 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  23.81 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  28.32 
 
 		 557 aa  127  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.14 
 
 		 469 aa  127  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  28.9 
 
 		 665 aa  127  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.16 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  29.81 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  28.38 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.75 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  30.75 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.23 
 
 		 497 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  29.8 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  26.58 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  30.75 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  30.75 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  30.98 
 
 		 491 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  28.51 
 
 		 613 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  29.07 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  27.61 
 
 		 545 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  26.58 
 
 		 530 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.72 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  30.18 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  26.58 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  32.07 
 
 		 541 aa  125  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  30.14 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  37.91 
 
 		 262 aa  125  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  28.88 
 
 		 539 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.23 
 
 		 611 aa  124  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  30.92 
 
 		 608 aa  124  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 344 aa  124  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  28.12 
 
 		 557 aa  124  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 613 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>