More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28051 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02681  ABC transporter ATP-binding protein  57.76 
 
 
534 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1559  ATPase  57.87 
 
 
534 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  74.57 
 
 
546 aa  802    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  74.38 
 
 
546 aa  800    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02101  ABC transporter, ATP binding component  65.11 
 
 
536 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
561 aa  1126    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  48.99 
 
 
548 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  48.81 
 
 
548 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  47.26 
 
 
552 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  46.65 
 
 
549 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  50.19 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  46.84 
 
 
550 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  41.09 
 
 
531 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  47.14 
 
 
567 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0194  ATPase  40.34 
 
 
532 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02101  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
532 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02121  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  42.91 
 
 
557 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
594 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.22 
 
 
549 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 
539 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.35 
 
 
546 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.14 
 
 
612 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  41.23 
 
 
558 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  40.41 
 
 
611 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  40.19 
 
 
545 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  39.35 
 
 
610 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  40.22 
 
 
566 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
547 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
554 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  39.81 
 
 
557 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  42.66 
 
 
592 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  42.47 
 
 
592 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  39.85 
 
 
557 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
601 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  42.27 
 
 
592 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  39.2 
 
 
562 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  40.07 
 
 
611 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.73 
 
 
564 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  38.13 
 
 
530 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  39.29 
 
 
533 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  38.08 
 
 
609 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  42.49 
 
 
585 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.04 
 
 
537 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  40 
 
 
561 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  40.87 
 
 
527 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  38.55 
 
 
564 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.33 
 
 
550 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  37.19 
 
 
566 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  40.36 
 
 
602 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.47 
 
 
611 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  39.01 
 
 
576 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.75 
 
 
615 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  38.99 
 
 
565 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  38.58 
 
 
588 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 
527 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  41.57 
 
 
545 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 
571 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.7 
 
 
617 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  39.48 
 
 
543 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  39.96 
 
 
553 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
593 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  40.04 
 
 
537 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  38.19 
 
 
571 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  39.19 
 
 
571 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  40.04 
 
 
611 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.42 
 
 
643 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  39.78 
 
 
541 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  39.55 
 
 
537 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  40.8 
 
 
536 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  38.36 
 
 
543 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  41.76 
 
 
539 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
571 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
619 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  41.09 
 
 
541 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.74 
 
 
536 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  41.62 
 
 
534 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  35.98 
 
 
530 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  40.3 
 
 
537 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  35.98 
 
 
530 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  33.93 
 
 
564 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.17 
 
 
599 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  39.44 
 
 
536 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  40.9 
 
 
542 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.92 
 
 
643 aa  365  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  40.04 
 
 
544 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  39.89 
 
 
557 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  39.89 
 
 
531 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  38.78 
 
 
599 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  36.65 
 
 
619 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.97 
 
 
539 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.4 
 
 
571 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  40.97 
 
 
586 aa  364  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  40.38 
 
 
546 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  42.86 
 
 
571 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.26 
 
 
550 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
565 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  41.47 
 
 
540 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
539 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.97 
 
 
539 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>