More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1559 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02101  ABC transporter, ATP binding component  56.95 
 
 		 536 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1559  ATPase  100 
 
 		 534 aa  1090    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  56.5 
 
 		 546 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02681  ABC transporter ATP-binding protein  97.57 
 
 		 534 aa  1061    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 561 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  56.06 
 
 		 546 aa  631  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  44.98 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  44.8 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  44.11 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0194  ATPase  45.47 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  44.03 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02101  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  43.58 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02121  ABC transporter ATP-binding protein  44.88 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  42.88 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  44.47 
 
 		 536 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  43.27 
 
 		 567 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  38.78 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  38.08 
 
 		 564 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  38.3 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.3 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  38.39 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.22 
 
 		 612 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  38.3 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  38.52 
 
 		 615 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  37.94 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  38.92 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  37.52 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  39.96 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  37.79 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  38.87 
 
 		 550 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  39.63 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.5 
 
 		 564 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  37.02 
 
 		 592 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  37.84 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 549 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 609 aa  362  8e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.63 
 
 		 545 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 530 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  36.35 
 
 		 566 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  38.12 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  39.46 
 
 		 551 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 530 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  37.15 
 
 		 542 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  37.14 
 
 		 609 aa  360  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 540 aa  359  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  37.1 
 
 		 572 aa  359  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.36 
 
 		 575 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  37.48 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  36.82 
 
 		 592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  37.97 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  36.63 
 
 		 592 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  39.31 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  36.73 
 
 		 573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  37.66 
 
 		 610 aa  356  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  37.86 
 
 		 588 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 		 539 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  36.17 
 
 		 571 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 		 543 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  38.33 
 
 		 611 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  38.22 
 
 		 613 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 554 aa  355  8.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  37.64 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  37.87 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  38.86 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  36.67 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  36.12 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  38.42 
 
 		 556 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  38.92 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  36.25 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  37.06 
 
 		 548 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.36 
 
 		 611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  37.89 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  38.92 
 
 		 539 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  36.94 
 
 		 538 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  37.89 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  38.37 
 
 		 529 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  37.89 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  37.38 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 		 548 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 564 aa  352  8e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  37.74 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  39.48 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  36.08 
 
 		 578 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.34 
 
 		 593 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.57 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  38.03 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  35.38 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  37.52 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  38.16 
 
 		 552 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  36.64 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  38.7 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.32 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>