More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0194 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  69.42 
 
 
531 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02101  ABC transporter ATP-binding protein  95.11 
 
 
532 aa  1003    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0194  ATPase  100 
 
 
532 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02121  ABC transporter ATP-binding protein  94.55 
 
 
532 aa  972    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 
561 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02681  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 
534 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02101  ABC transporter, ATP binding component  44.4 
 
 
536 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1559  ATPase  46.06 
 
 
534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  38.29 
 
 
546 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  38.48 
 
 
546 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  36.95 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  36.76 
 
 
548 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1305  ATPase  34.35 
 
 
536 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  37.02 
 
 
552 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  35.91 
 
 
567 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4993  ABC transporter-like  34.75 
 
 
550 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1646  ABC transporter-like protein protein  34.38 
 
 
549 aa  363  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.495994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  35.49 
 
 
549 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  34.46 
 
 
537 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  33.21 
 
 
548 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  35.39 
 
 
522 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 
547 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  34.57 
 
 
546 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  33.45 
 
 
593 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  35.28 
 
 
537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.64 
 
 
536 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  34.29 
 
 
527 aa  335  9e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  34.8 
 
 
536 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  33.9 
 
 
537 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  33.33 
 
 
531 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  35.21 
 
 
525 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
527 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  35.84 
 
 
558 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  33.94 
 
 
593 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  34.45 
 
 
536 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  33.46 
 
 
542 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 
536 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  34.9 
 
 
527 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  33.89 
 
 
533 aa  330  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  34.64 
 
 
535 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  34.26 
 
 
536 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  34.73 
 
 
530 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  34.73 
 
 
530 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  34.08 
 
 
544 aa  329  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  34.9 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  33.08 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  33.46 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  32.89 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  33.9 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  33.21 
 
 
545 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  34.54 
 
 
557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  33.02 
 
 
537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 
530 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  35.5 
 
 
533 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  34.64 
 
 
546 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  35.62 
 
 
549 aa  326  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  33.58 
 
 
534 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 
548 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  31.52 
 
 
588 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 
549 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.9 
 
 
525 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 
534 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  33.83 
 
 
555 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  31.8 
 
 
554 aa  323  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  34.3 
 
 
569 aa  323  5e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.98 
 
 
564 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  32.51 
 
 
534 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  34.39 
 
 
542 aa  323  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  33.52 
 
 
556 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
539 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  34.39 
 
 
540 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  34.94 
 
 
535 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  32.85 
 
 
571 aa  322  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  32.12 
 
 
548 aa  322  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  32.15 
 
 
544 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  34.74 
 
 
571 aa  322  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  33.09 
 
 
570 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.58 
 
 
575 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  35.79 
 
 
564 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  35.25 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  33.27 
 
 
552 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  33.52 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  32.9 
 
 
569 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  33.21 
 
 
543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  33.71 
 
 
573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  31.62 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  32.83 
 
 
543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  31.56 
 
 
576 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  34.94 
 
 
545 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  33.52 
 
 
559 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  32.22 
 
 
630 aa  321  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  34.01 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  34.01 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.25 
 
 
616 aa  319  6e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.96 
 
 
536 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.6 
 
 
577 aa  320  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  34.38 
 
 
541 aa  319  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  31.33 
 
 
571 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  34.32 
 
 
568 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
602 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>