38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0892 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  37.77 
 
 		 796 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  36.69 
 
 		 695 aa  346  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  35.78 
 
 		 676 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  42.05 
 
 		 896 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  30.89 
 
 		 682 aa  55.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.14 
 
 		 693 aa  53.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  20.22 
 
 		 741 aa  53.5  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  44.62 
 
 		 869 aa  52.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  25.31 
 
 		 658 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  27.44 
 
 		 887 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  28.09 
 
 		 1051 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  27.44 
 
 		 887 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  43.94 
 
 		 874 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  31.09 
 
 		 849 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  37.66 
 
 		 854 aa  48.9  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 881 aa  48.5  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  32.93 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  33.64 
 
 		 770 aa  48.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  36.36 
 
 		 891 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  35.71 
 
 		 1011 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.49 
 
 		 873 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  38.33 
 
 		 1208 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0003  recombination protein F  51.28 
 
 		 361 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  34.95 
 
 		 808 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  30.21 
 
 		 895 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  36.05 
 
 		 880 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 840 aa  47  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  36.49 
 
 		 872 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  29.27 
 
 		 712 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  29.27 
 
 		 712 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  39.29 
 
 		 687 aa  46.2  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  32.91 
 
 		 758 aa  45.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  32.91 
 
 		 758 aa  45.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  36.19 
 
 		 246 aa  45.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  44.68 
 
 		 367 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  22.22 
 
 		 879 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  41.67 
 
 		 357 aa  44.3  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>