37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5100 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  100 
 
 		 676 aa  1331    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  67.42 
 
 		 695 aa  863    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  37.2 
 
 		 796 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  35.13 
 
 		 890 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  37.23 
 
 		 873 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  41.18 
 
 		 808 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  28.87 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1179 aa  48.9  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  43.64 
 
 		 687 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  35.45 
 
 		 784 aa  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  35.14 
 
 		 872 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  39.44 
 
 		 868 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 879 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  41.54 
 
 		 874 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  33.68 
 
 		 1059 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  26.07 
 
 		 955 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  38.67 
 
 		 881 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 		 1153 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  53.06 
 
 		 346 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  38.1 
 
 		 1177 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.08 
 
 		 789 aa  45.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1385  SMC protein-like protein  33.02 
 
 		 1091 aa  45.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 833 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  35.54 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  22.91 
 
 		 225 aa  45.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  21.2 
 
 		 693 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  46 
 
 		 874 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1185 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  43.18 
 
 		 1205 aa  44.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  31.37 
 
 		 895 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  37.5 
 
 		 880 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  40.62 
 
 		 874 aa  44.3  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  40.91 
 
 		 1301 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  35.45 
 
 		 235 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  40.62 
 
 		 874 aa  44.3  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1198 aa  43.9  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>