40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4596 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1776    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  34.23 
 
 		 875 aa  522  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  37.11 
 
 		 1051 aa  99.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  32.82 
 
 		 1036 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  28.48 
 
 		 1059 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  26.57 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  26.47 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 		 1041 aa  55.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  35.71 
 
 		 1213 aa  52  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  37.35 
 
 		 1214 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  36.9 
 
 		 1214 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  37.35 
 
 		 1214 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  37.35 
 
 		 1214 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  24.82 
 
 		 687 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  25.58 
 
 		 663 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  25 
 
 		 796 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  28.45 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  29.41 
 
 		 683 aa  48.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  37.35 
 
 		 784 aa  48.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  27.27 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  38.89 
 
 		 514 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  35.21 
 
 		 339 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  32.94 
 
 		 1244 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  35.21 
 
 		 1146 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  34.12 
 
 		 1211 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  45.65 
 
 		 686 aa  45.8  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  22.98 
 
 		 690 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  22.22 
 
 		 890 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  32.63 
 
 		 1211 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.07 
 
 		 365 aa  45.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  30.36 
 
 		 808 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  30.19 
 
 		 1185 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.24 
 
 		 423 aa  44.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.17 
 
 		 353 aa  45.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  34.88 
 
 		 1214 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1308 aa  44.3  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  34.88 
 
 		 1214 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  38.18 
 
 		 875 aa  44.3  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  35.21 
 
 		 1188 aa  44.3  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 		 340 aa  44.3  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>