18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4388 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1041 aa  2110    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  32.56 
 
 		 1059 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  40.51 
 
 		 1051 aa  61.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  33.7 
 
 		 1036 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  28.97 
 
 		 929 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  31.13 
 
 		 879 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 804 aa  55.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  41.03 
 
 		 985 aa  55.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  32.48 
 
 		 657 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 		 682 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  31.5 
 
 		 808 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  36.26 
 
 		 687 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  30.43 
 
 		 263 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.12 
 
 		 263 aa  46.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  31.4 
 
 		 1080 aa  45.8  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.98 
 
 		 382 aa  45.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  27.06 
 
 		 250 aa  45.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.94 
 
 		 353 aa  44.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>