18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0040 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  100 
 
 		 1051 aa  2067    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  30.54 
 
 		 1059 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  40.1 
 
 		 1036 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  36.48 
 
 		 985 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  37.11 
 
 		 879 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  34.67 
 
 		 875 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  40.51 
 
 		 1041 aa  61.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  25.45 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  24.52 
 
 		 687 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  27.66 
 
 		 808 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  28.87 
 
 		 676 aa  51.2  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  28.09 
 
 		 890 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  29.41 
 
 		 695 aa  48.5  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  28.47 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  27.27 
 
 		 796 aa  48.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  26.63 
 
 		 741 aa  45.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  34.15 
 
 		 803 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  30.12 
 
 		 810 aa  44.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>