31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0065 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  100 
 
 		 985 aa  2011    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  36.48 
 
 		 1051 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  25.4 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  26.47 
 
 		 879 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  41.03 
 
 		 1041 aa  55.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  23.24 
 
 		 1059 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  29.77 
 
 		 875 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  48.08 
 
 		 690 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  27.68 
 
 		 1036 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  24.57 
 
 		 682 aa  49.7  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1200 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  39.08 
 
 		 433 aa  48.5  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  28.14 
 
 		 1165 aa  48.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  32.26 
 
 		 664 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  47.46 
 
 		 362 aa  47.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  28.7 
 
 		 1240 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1201 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1204 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  31.21 
 
 		 1261 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  26.36 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1192 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1164 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1164 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  41.18 
 
 		 686 aa  45.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  50 
 
 		 449 aa  45.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.1 
 
 		 378 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.67 
 
 		 1174 aa  45.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  39.39 
 
 		 1226 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.12 
 
 		 961 aa  45.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  39.39 
 
 		 1226 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  39.02 
 
 		 1031 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>