23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4583 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  100 
 
 
875 aa  1773    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  33.96 
 
 
879 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  34.67 
 
 
1051 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  27.59 
 
 
1036 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  27.07 
 
 
1059 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  29.77 
 
 
985 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  27.45 
 
 
514 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5480  hypothetical protein  40.58 
 
 
1304 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  23.23 
 
 
682 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  24.46 
 
 
796 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  33.33 
 
 
808 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.08 
 
 
1174 aa  46.6  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.17 
 
 
353 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  43.1 
 
 
663 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 
339 aa  46.6  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  43.4 
 
 
683 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  27.01 
 
 
702 aa  47  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  29.66 
 
 
671 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  40 
 
 
1025 aa  45.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  35.38 
 
 
1016 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  25.9 
 
 
666 aa  44.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  37.7 
 
 
1008 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  35.85 
 
 
427 aa  44.3  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>