71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2201 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  56.67 
 
 		 693 aa  802    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  59.88 
 
 		 690 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1410    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  56.67 
 
 		 693 aa  801    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 		 699 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  25.15 
 
 		 663 aa  157  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  24.61 
 
 		 686 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  20.62 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  21.71 
 
 		 671 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  22.83 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  20.65 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  22.42 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  24.73 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 642 aa  70.5  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  21.73 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  22.3 
 
 		 661 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  28.1 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  24.77 
 
 		 395 aa  67  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  22.14 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  20.21 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  21.74 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  29.68 
 
 		 660 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  24.12 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  23.99 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  27.83 
 
 		 673 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  27.76 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  25.96 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  30.16 
 
 		 1019 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.77 
 
 		 895 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.06 
 
 		 902 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  26.47 
 
 		 660 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  48.08 
 
 		 985 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  32.99 
 
 		 1232 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  25.6 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 		 676 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 		 1019 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.64 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  29.92 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.88 
 
 		 924 aa  47.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1153 aa  47.4  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  21.89 
 
 		 663 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.92 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  29.9 
 
 		 859 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  29.9 
 
 		 859 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  21.85 
 
 		 436 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.52 
 
 		 891 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.92 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  22.11 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  35.63 
 
 		 1151 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  32.86 
 
 		 986 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.9 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 		 1346 aa  46.6  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  25.65 
 
 		 1017 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.14 
 
 		 993 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  35.14 
 
 		 993 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  22.98 
 
 		 879 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  25.58 
 
 		 260 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  30.11 
 
 		 1022 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1175 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  40.74 
 
 		 514 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  30.68 
 
 		 1208 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  21.6 
 
 		 1021 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  36.07 
 
 		 1190 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1167 aa  44.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1198 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  48.98 
 
 		 628 aa  44.3  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  30 
 
 		 890 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.66 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  34.78 
 
 		 1163 aa  43.9  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  36.07 
 
 		 1151 aa  43.9  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>