27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2312 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  26.51 
 
 		 657 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  31.06 
 
 		 686 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  24.29 
 
 		 677 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  27.41 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  24.1 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  25.96 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  23.94 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  28.41 
 
 		 662 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  24.54 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 1038 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  25 
 
 		 673 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  23.95 
 
 		 663 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  25.77 
 
 		 693 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  25.77 
 
 		 693 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  22.89 
 
 		 661 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  23.53 
 
 		 690 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  22.54 
 
 		 661 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.88 
 
 		 1029 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  23.81 
 
 		 671 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  25.58 
 
 		 690 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  25.1 
 
 		 660 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  24.73 
 
 		 668 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  30.14 
 
 		 794 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  24.36 
 
 		 660 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.07 
 
 		 1029 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  25.51 
 
 		 683 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>