34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3181 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  800    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  36.54 
 
 		 354 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  32.77 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  36 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  35.4 
 
 		 660 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  28.74 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  28.42 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.77 
 
 		 690 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  30.48 
 
 		 677 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  26.63 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.57 
 
 		 676 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  30.69 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  32.03 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  29.31 
 
 		 673 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  30.83 
 
 		 672 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  31.91 
 
 		 658 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  22.74 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  24.07 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  32.56 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  35.29 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  30.3 
 
 		 664 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  31.2 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  31.2 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  33.73 
 
 		 660 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  23.65 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.28 
 
 		 955 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.26 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  31.33 
 
 		 660 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  35.38 
 
 		 663 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  28.03 
 
 		 829 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  22.3 
 
 		 699 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  23.95 
 
 		 891 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  28.5 
 
 		 888 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.34 
 
 		 789 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>