30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1983 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  100 
 
 		 436 aa  892    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  39.13 
 
 		 676 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  38 
 
 		 666 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  26.59 
 
 		 677 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  29.89 
 
 		 662 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  45.95 
 
 		 671 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  34.62 
 
 		 661 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  35.11 
 
 		 673 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  38.07 
 
 		 664 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  41.95 
 
 		 668 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  34.62 
 
 		 661 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  42.47 
 
 		 660 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  30.8 
 
 		 658 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  30.42 
 
 		 671 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  32.53 
 
 		 663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  29.09 
 
 		 660 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  41.54 
 
 		 660 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  30.13 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  33.15 
 
 		 683 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  35.09 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  26.63 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  32 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  24.42 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  22.22 
 
 		 891 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  21.85 
 
 		 690 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.16 
 
 		 890 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  27.55 
 
 		 665 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  24.7 
 
 		 924 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.71 
 
 		 902 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>