102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00117 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  100 
 
 		 704 aa  1451    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  21.78 
 
 		 693 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  21.78 
 
 		 693 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  20.62 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  20.67 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  42.59 
 
 		 1179 aa  57.4  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  30.14 
 
 		 1081 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 676 aa  54.3  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1255 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  37.04 
 
 		 1115 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  24.26 
 
 		 642 aa  52  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  37.04 
 
 		 1205 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  38.89 
 
 		 1191 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  37.7 
 
 		 922 aa  50.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  37.04 
 
 		 1199 aa  50.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1184 aa  50.8  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1183 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1222 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  22.11 
 
 		 683 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  29.82 
 
 		 912 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1195 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1217 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1218 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1203 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  41.18 
 
 		 1307 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  41.18 
 
 		 1318 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  41.18 
 
 		 1280 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  40.74 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  24.43 
 
 		 663 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 		 353 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  36.54 
 
 		 1194 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1172 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1186 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  37.25 
 
 		 1195 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  37.04 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  37.25 
 
 		 1195 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  37.25 
 
 		 1195 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1263 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1214 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  29.7 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1201 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1217 aa  48.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1181 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  33.33 
 
 		 1227 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  39.22 
 
 		 1174 aa  47.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  36.51 
 
 		 1191 aa  47.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1222 aa  47.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1186 aa  47.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1188 aa  47.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  33.71 
 
 		 1139 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1200 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  31.48 
 
 		 1225 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1175 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1213 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  26.04 
 
 		 541 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  36.36 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  39.22 
 
 		 935 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1192 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1198 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1191 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1234 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  42.59 
 
 		 859 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  37.04 
 
 		 1175 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.04 
 
 		 1176 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  35.19 
 
 		 1199 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 		 859 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1191 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1301 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1199 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1199 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 1061 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  30.43 
 
 		 1082 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1189 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 		 1224 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  31.48 
 
 		 1190 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  42.59 
 
 		 859 aa  45.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  41.3 
 
 		 422 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1144 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  21.72 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  35.19 
 
 		 1198 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  25.93 
 
 		 677 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1190 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  35.19 
 
 		 1208 aa  44.3  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  31.48 
 
 		 1187 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  21.84 
 
 		 671 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  36.54 
 
 		 994 aa  44.7  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 		 1181 aa  44.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  42 
 
 		 339 aa  44.3  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  41.3 
 
 		 421 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  39.62 
 
 		 1209 aa  43.9  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1173 aa  43.9  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  27.78 
 
 		 987 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>