40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2475 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1319    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  39.53 
 
 		 664 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  33.28 
 
 		 661 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  32.98 
 
 		 661 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  34.63 
 
 		 668 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  34.18 
 
 		 662 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  33.68 
 
 		 660 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  29.81 
 
 		 666 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  28.32 
 
 		 677 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  27.96 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  29.19 
 
 		 660 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.01 
 
 		 676 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  28.14 
 
 		 660 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  26.49 
 
 		 663 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  26.55 
 
 		 683 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  24.72 
 
 		 671 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  42.68 
 
 		 671 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  30.8 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  30.92 
 
 		 672 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  22.83 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  22.22 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  22.55 
 
 		 690 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  28.85 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  20.74 
 
 		 693 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  20.6 
 
 		 693 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  28.22 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  43.96 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  31.91 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.5 
 
 		 924 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.43 
 
 		 895 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  25.31 
 
 		 890 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  30.43 
 
 		 891 aa  51.2  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.03 
 
 		 890 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.93 
 
 		 902 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  27.01 
 
 		 642 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  34.12 
 
 		 804 aa  47.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  40.82 
 
 		 1013 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  25.73 
 
 		 817 aa  45.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  43.75 
 
 		 955 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  27.61 
 
 		 694 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>