34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2311 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  36.54 
 
 
395 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  31.55 
 
 
677 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  28.08 
 
 
693 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  29.05 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  28.08 
 
 
693 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  40.62 
 
 
676 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  37.5 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  37.5 
 
 
661 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  39.29 
 
 
668 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  35.09 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  35.83 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  35.79 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  39.53 
 
 
671 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  27.37 
 
 
690 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  35.58 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  35.78 
 
 
683 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  43.96 
 
 
658 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  25.44 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  24.86 
 
 
671 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  47.69 
 
 
664 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  29.66 
 
 
672 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  31.67 
 
 
663 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.12 
 
 
690 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  34.82 
 
 
663 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  38.82 
 
 
660 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  29.76 
 
 
660 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  22.71 
 
 
924 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  23.38 
 
 
895 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.35 
 
 
890 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.76 
 
 
891 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.25 
 
 
926 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  36.99 
 
 
699 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>